基于代谢组学探究甲基化转移酶基因的功能特性
Exploring the Functional Characteristics of Methyltransferase Gene Based on Metabolomics Technology
摘要为探究DNA甲基化调控DNA序列与蛋白间的相互作用与对细胞功能产生的影响.本文采用超高效液相色谱-质谱联用仪比对甲基化转移酶突变体副干酪乳酪杆菌Zhang△2054和野生型副干酪乳酪杆菌Zhang在对数生长期(12h)的差异代谢物,同时进行多变量统计分析.结合数据库搜索和质量光谱信息匹配,共得到33个显著差异的代谢物,其中上调和下调的显著差异代谢物分别有10和23种,主要包括嘌呤、嘧啶及其类似物,核苷、核苷酸和类似物,氨基酸及其衍生物、碳水化合物和碳水化合物结合物等,并富集在嘌呤代谢、嘧啶代谢、赖氨酸生物合成、核黄素代谢、丙酸代谢、磷酸戊糖等代谢通路中.LCAZH_2054基因虽不是甲基化表型的控制基因,但在参与菌株新陈代谢过程中发挥着重要作用.本研究通过代谢组学的分析,揭示甲基化转移酶突变体副干酪乳酪杆菌Zhang△2054和野生型副干酪乳酪杆菌Zhang在化学成分限制培养基中的生长代谢差异情况,并讨论了LCAZH_2054基因对生长代谢过程中营养物质的利用以及代谢产物生成等生物学功能的影响.
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