基于全基因组和比较基因组分析罗伊氏粘液乳杆菌的益生特性
Probiotic Properties of Limosilactobacillus reuteri Based on Whole-genome and Comparative Genome Analysis
摘要目的:旨在挖掘罗伊氏粘液乳杆菌相关功能基因,以期后续为罗伊氏粘液乳杆菌在食品工业中的开发和应用提供依据.方法:以罗伊氏粘液乳杆菌AR673为对象,通过全基因组测序和比较基因组分析,解析罗伊氏粘液乳杆菌AR673潜在益生功能的分子基础和相关基因.结果:罗伊氏粘液乳杆菌AR673基因组无质粒,染色体长2.04Mbp,GC含量38.88%,包含2 016个蛋白质编码基因.功能分析发现罗伊氏粘液乳杆菌AR673包含抗菌活性物质合成基因,与环境压力耐受性相关基因以及可移动元件.比较基因组分析发现37株罗伊氏粘液乳杆菌泛基因组呈开放型,数量为5 066个,核心基因为1190个,另外,还包含1 167个菌株特异性基因.系统发育分析显示罗伊氏粘液乳杆菌AR673和罗伊氏粘液乳杆菌TK-F8A同源性最高,可能具备抑制病原微生物生长,增强宿主免疫系统等益生特性.结论:本研究为丰富罗伊氏粘液乳杆菌的物种进化库,挖掘罗伊氏粘液乳杆菌潜在的益生功能奠定了基础.
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