热带爪蟾Hoxall基因克隆及序列的进化分析
Cloning and Sequential Evolution Analysis of Hoxa11 Gene from Xenopus tropicalis
摘要Hoxa11基因是控制脊椎动物肢发育的重要基因.根据人和鼠Hoxa11基因外显子Ⅰ区和Ⅱ区的保守序列设计了简并引物,采用PCR法从热带爪蟾基因组DNA中扩增和克隆到了Hoxa11基因,并测定了核苷酸序列.克隆的热带爪蟾Hoxa11基因片段长1 598 bp,由外显子Ⅰ、内含子和外显子Ⅱ三部分组成,其中外显子Ⅰ 604 bp,外显子Ⅱ 49 bp.将该片段的核苷酸序列与人、鼠、斑马鱼Hoxa11基因的相应区域进行比较,发现该基因的内含子长度存在明显差异.斑马鱼、热带爪蟾、鼠和人的内含子长度分别为632 bp,945 bp,1 421 bp和1 412 bp,随动物进化阶梯的提高而变长.外显子Ⅱ区则高度保守,都是49 bp,外显子Ⅰ区在长度上呈现约10%的变异.将热带爪蟾Hoxa11基因编码的氨基酸序列与人、鼠、斑马鱼进行比较,它们之间分别有67.0%、66.5%和46.0%的同源性.热带爪蟾与哺乳动物的同源性高于鱼类,可能反映了脊椎动物从鳍到肢的进化过程中,Hoxa11基因经历了较多的变异.
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