换一批蚕豆萎蔫病毒2号山西分离株的全基因组序列测定与分析
Identification and Analysis of Complete Genomic Sequence of Broad bean wilt virus 2 Shanxi Isolate
摘要本试验在生物学接种的基础上,利用非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)对感病青椒(Capsicum annuum)进行了分子鉴定.序列测定及分析发现,侵染青椒的病毒为蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus 2,BBWV2).为明确BBWV2青椒分离物(BBWV2-Ca)的分类地位,对BBWV2-Ca的全基因组序列进行了分段克隆、序列测定和分析.BBWV2-Ca RNA1全长5 929 bp,含有1个ORF.BBWV2-Ca RNA2全长3 559 bp,含有1个ORF,编码3种蛋白:VP53/VP37、外壳蛋白大亚基(large coat protein,LCP)和外壳蛋白小亚基(small coat protein,SCP).全序列核苷酸同源性分析显示,BBWV2-Ca RNA1与BBWV2其它分离物核苷酸同源性在77.9％～93.7％之间;RNA2与BBWV2其它分离物核苷酸同源性在80.2％～93.8％之间.全序列系统进化分析显示,BBWV2-Ca RNA1与BBWV2-XJ14-3以及BBWV2-RP3株系聚为一簇,亲缘关系最近;RNA2与BBWV2-Am形成一个独立分支,亲缘关系最近.
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分类号
S432.4
栏目名称
DOI
10.13865/j.cnki.cjbmb.2014.09.14
发布时间
2014-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
公益性行业(农业)科研专项经费（(No.201303028)）
山西省自然科学基金项目（(No.2012011032-5)）
Supported by Special Fund for Agro-scientific Research in Public Interest（(No.201303028)）
Natural Science Foundation of Shanxi（(No.2012011032-5)）
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