换一批基于Illumina测序的厚壳贻贝足组织转录组研究
Illumina-based De novo Sequencing and Characterization of Mytilus coruscus Foot Transcriptome
摘要贻贝足丝是贻贝足组织分泌的足丝蛋白形成的非细胞组织,具有在水环境下的极强粘附性能,是当前生物粘附剂及抗腐蚀材料的研发热点.为进一步了解贻贝足丝蛋白的分子多样性特征,采用新一代Illumina高通量测序平台对厚壳贻贝(Mytilus coruscus)足组织进行转录组测序,首次构建了厚壳贻贝足组织的转录组数据库.共计获得7 199 799 840 nt的碱基数据.经过序列拼接和组装,获得88 825条unigene.对上述unigene开展了序列注释,共计37 007条unigene获得注释.在此基础上,经序列检索和比对,从中筛选出与目前已知的1 1种足丝蛋白同源的56条unigene序列并进行分析.结果表明,厚壳贻贝足丝蛋白具有明显的氨基酸偏好性,部分足丝蛋白具有重复序列,且厚壳贻贝足丝蛋白与其他种类的贻贝足丝蛋白具有较高的序列相似性.上述结果为后续贻贝足丝蛋白的批量鉴定以及在此基础上的贻贝足丝形成、固化以及粘附机制相关研究奠定了基础.
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分类号
Q71（生物大分子的结构和功能）
栏目名称
DOI
10.13865/j.cnki.cjbmb.2015.08.14
发布时间
2015-09-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
湖南师范大学“蛋白质化学与发育生物学”教育部重点实验室开放基金课题（(No.2015DF02)）
国家大学生创新创业训练计划项目（(No.201410340002)）
Supported by Key Laboratory of Protein Chemistry and Developmental Biology of the Ministry of Education （(No.2015DF02)）
The National College Students,Innovative Entrepreneurial Training Plan （(No.201410340002)）
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