换一批基于频繁项集挖掘和连续帧间差分的脂肪酶时-空结构模式与耐热性的关系
Relationship between Time-Space Structure Pattern and Thermal Stability of Lipase Based on Frequent Itemsets Mining and Successive Frame Difference
摘要酶的热稳定性问题一直是蛋白质工程领域关注的重点.本研究通过枯草芽孢杆菌脂肪酶的不同模拟温度下的分子动力学模拟轨迹,分析野生型脂肪酶(WTL)及其突变体(6B)残基间相互作用对热稳定性的影响.首先确定残基间的空间关系,采用空间聚类和FP-growth算法,识别出保持协同运动的β3-β8以及C端部分区域,即确定刚性区;接着运用连续帧间差分法确定波动较大的柔性区,发现其主要位于转角处.以300 K常温状态下识别出的刚性区和柔性区为基础,考察刚性区和柔性区在不同温度下相互作用的动态变化规律,发现WTL和6B的刚性区内的相互作用几乎不随温度发生变化,在高温400 K时,WTL柔性区的稳定氢键数急剧减少为7,6B柔性区的稳定氢键数随温度变化较为稳定.另外,6B的柔性区较WTL少了310螺旋,这是由于突变后的Ser15与突变后的Ser17形成强大的氢键作用,A15S和F17S突变改善了脂肪酶结构的柔性使其热稳定性增强.
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关键词
热稳定性空间聚类FP-growth算法连续帧间差分法thermal stabilityspatial clusteringFP-growth algorithmcontinuous inter-frame difference method
分类号
Q71（生物大分子的结构和功能）
栏目名称
DOI
10.13865/j.cnki.cjbmb.2018.03.09
发布时间
2018-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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