长非编码RNA TNRC6CAS1作为ceRNA在肥厚型心肌病发生发展中调控BPTF表达的研究
lncRNA TNRC6CAS1 as ceRNA Regulates BPTF Expression in the Development of Hypertrophic Cardiomyopathy
摘要肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)是一种以心肌细胞肥厚为特征的原发性心肌病,其发病的分子机制尚未明确.本研究整合Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中编号GSE130036和GSE36946的数据集.利用R语言对数据集中的RNA表达矩阵进行表达差异性分析.对差异mRNA进行生物功能富集分析,明确研究对象染色质重塑因子以BPTF(bromodomain PHD finger transcription factor)为核心.预测 miRNA 靶向 mRNA 和 lncRNA 的结合位点,构建 ln-cRNA TNRC6CAS1,miR-30c-1-3p-BPTF 内源竞争 RNA(ceRNA)网络.利用实时定量 PCR,酶联免疫吸附测定或免疫印迹检测,在肥厚型心肌病临床样本(20例健康人和20例肥厚型心肌病患者外周血)和心肌肥大细胞模型中验证了 BPTF和lncRNA TNRC6CAS1表达的明显上调(P<0.001),而miR-30c-1-3p的表达明显下调(P<0.001).同时,在AC16细胞中对三者的表达相关性进行初步验证.最后,分别沉默BPTF,lncRNA TNRC6CAS1或过表达miR-30c-1-3p可以抑制心肌肥大标志性蛋白质的表达.以上结果表明,lncRNA TNRC6CAS1,miR-30c-1-3p,BPTF 构成的ceRNA网络可能参与调控肥厚型心肌病心肌肥大病理现象的产生.三者作为潜在的肥厚型心肌病致病分子,有望成为新的检测和治疗靶点.
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