换一批核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法
Nucleic Acid-barcoding Technologies:A New Method for Extending High-throughput Protein-Protein Interactions
摘要蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义.目前,下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)发展快速,能在几天内测定超过10亿个模板的DNA序列.由于并行DNA测序技术所特有的敏感性、特异性、高通量和多路复用优势,其已被用作广谱分子计数器,应用于基因组测序和转录物组测序等领域.核酸条形码技术通过将寡核苷酸标签与 目标蛋白质连接起来,从而标记编码蛋白质.之后,利用高通量的测序方法检测相互作用的蛋白质,实现了 PPI的高通量检测.这一技术推动了 PPI检测方法的飞速发展,提升了单次实验检测的通量,为构建PPI网络提供了强有力的技术支持.本文详细阐述了核酸条形码在PPI检测方法中的设计、生成和读取;通过分析核酸条形码技术在PPI研究中的应用范例,探讨了各自的优势和不足,并评估了数据的可靠性,讨论了基于核酸条形码技术的PPI检测方法未来的发展趋势.
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关键词
蛋白质-蛋白质相互作用核酸条形码检测技术下一代测序技术protein-protein interaction(PPI)nucleic acid barcode technologynext-generation sequencing
分类号
Q51（蛋白质）
栏目名称
DOI
10.13865/j.cnki.cjbmb.2023.07.1085
发布时间
2024-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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