成对甘氨酸基序(Gly-Gly)对胶原蛋白稳定性及柔性的影响
The Effect of the Glycine Pair Motifs(Gly-Gly)on the Stability and Flexibility of Collagen
摘要胶原蛋白是动物体内各种组织维持其功能所必需的基质蛋白质,脊椎动物中有多种类型,每种类型的胶原蛋白在体内的功能与其序列和拮构均有着密切联系.在天然胶原中,除了普遍的Gly-X-Y氨基酸序列,也存在一种特殊拮构Gly-Gly-Y,为了探究其对胶原的影响,本研究依次在胶原多肽、长链胶原、胶原高聚物层次上构建含有Gly-Gly-Y的突变体,通过圆二色谱扫描表征突变前后胶原的热稳定性.同时,采用分子动力学模拟计算胶原多肽的氢键成键概率以及弯曲度,解释胶原稳定性和柔性变化的分子机制.结果显示,含有Gly-Gly拮构的突变体会降低样品的Tm值,但随着胶原三螺旋区域的加长以及蛋白质自组装程度的加强,这种影响会逐渐减弱,降低的Tm值分别为5℃、3℃和1℃.同时,模拟结果显示,含有Gly-Gly拮构的多肽弯曲度也有一定增加,表明突变位点附近拮构有更强的灵活性.这为具有一定柔性的胶原材料的设计提供了新思路.
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