换一批通过全基因组关联数据和人脑蛋白质组的综合分析鉴定与克雅氏病相关蛋白质
Identification of Novel Proteins for Creutzfeldt-Jakob Disease by Integrating Genome-wide Association Data and Human Brain Proteomes
摘要克雅氏病(Creutzfeldt-Jakob disease,CJD)是一种罕见的神经退行性疾病,以朊病毒蛋白(PrP)异常为特征,是人类朊病毒病中最常见的类型.尽管全基因组关联研究(GWAS)已鉴定出多个与CJD相关的风险基因,但这些风险位点的潜在机制仍不清楚.本研究旨在通过综合性分析流程,阐明与人类大脑中CJD相关的新型遗传学支持的候选蛋白质.通过蛋白质数量性状位点(pQTL)数据集(NpQTL1=152,NpQTL2=376)、表达数量性状位点(eQTL)数据集(N=452)以及CJD全基因组关联研究(GWAS)数据(NCJD=4 110,NControls=13 569),构建了一个系统性分析流程.该流程包括蛋白质组全关联研究(PWAS)、孟德尔随机化(MR)、贝叶斯共定位分析(Bayesian colocalization)和转录物组全关联研究(TWAS),旨在识别与大脑中CJD发病机制相关的新型遗传学支持的候选蛋白质.通过PWAS,鉴定出6种大脑蛋白质的丰度变化与CJD显著相关.其中,STX6和PDIA4被确立为CJD的主要因果基因,这一结论得到了强有力的证据支持(孟德尔随机化分析中FDR＜O.05;贝叶斯共定位分析中PP4/(PP3+PP4)≥0.75).具体而言,STX6和PDIA4的升高水平与CJD风险增加相关.此外,TWAS表明,STX6和 PDIA4在转录水平上也与CJD相关.
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关键词
克雅氏病孟德尔随机化数量性状基因座突触融合蛋白6蛋白质二硫键异构酶家族A成员4Creutzfeldt-Jakob disease(CJD)Mendelian randomizationquantitative trait locus(QTL)syntaxin 6(STX6)protein disulfide isomerase family A member 4(PDIA4)
分类号
Q754（分子遗传学）
栏目名称
DOI
10.13865/j.cnki.cjbmb.2025.06.1087
发布时间
2025-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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