小分子靶标适配体的筛选与鉴定策略

Screening and Identification Strategies of Aptamers for Small Molecules

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摘要小分子通常指分子量小于1 kD的天然化合物,它们在生物科学、医药卫生和环境科学等多领域有重要的研究价值.适配体(aptamers)作为一种新型的生物识别元件,可特异地与小分子等靶标以高亲和力结合.它们是由指数富集的配体系统进化(systematic evolution of ligands by exponential en-richment,SELEX)技术筛选而得的单链短核苷酸序列.与大分子靶标的适配体相比,小分子靶标的适配体常表现出筛选困难、亲和力低和特异性差等缺点.为了解决这些瓶颈问题,本文提供了一些小分子靶标适配体筛选与鉴定的策略.首先,设计小分子靶标适配体的筛选方案时,本文提出需将关注点放在文库设计、SELEX方法、扩增方法、筛选进程监测方法和适配体序列分析方法等关键环节或方法的选择上,依据实际情况选择或设计适宜的策略.其次,适配体的结构与亲和力直接影响着它们的应用,本文简要介绍了适配体二级结构和三级结构的分析方法以及常见的6种亲和力鉴定方法.最后,本文讨论了小分子靶标适配体筛选与鉴定中存在的一些问题,展望了未来发展前景.全文旨在为小分子靶标适配体筛选与鉴定的多个环节提供研究策略,为提高适配体筛选与鉴定效率提供参考.