基于全转录物组测序的长江江豚性别差异非编码RNA表达谱及功能分析
Expression Profiling and Functional Analysis of Non-coding RNAs in Sexual Dimorphism of the Yangtze Finless Porpoise Based on Whole Transcriptome Sequencing
摘要长江江豚(Neophocaena asiaeorientalis)是我国特有的淡水鲸类,种群数量仅约1 200头,属极度濒危物种.雌雄长江江豚在生长发育方面存在显著差异,为解析其性别差异的分子调控机制,本研究聚焦于非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)——一类关键的基因表达调控因子,在性别决定与分化中扮演重要角色.基于全转录物组测序技术,系统分析了雌雄长江江豚血液中ncRNA的差异表达谱及其功能注释.结果显示,共鉴定出205个差异表达环状RNA(雌性上调87个,下调118个)、122个差异表达的长非编码RNA(雌性上调54个,下调68个)和48个差异表达的微RNA(雌性上调32个,下调16个).功能富集分析表明,这些差异表达的ncRNA通过能量代谢(例如ATP结合、PI3K-Akt通路)、免疫调节及信号转导等核心生物学过程协同调控两性分化.荧光定量PCR对关键下游基因(MAPK1、IRS1、ALAD和C1QC)的验证结果,与测序数据揭示的调控趋势一致,为差异ncRNA的功能提供了间接实验证据.本研究系统揭示了 ncRNA在长江江豚性别差异中的多维调控网络,为理解其生理分化机制及制定濒危物种保护策略提供了分子层面的理论依据.
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