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抗CD28纳米抗体的晶体结构解析、分子对接模拟及抗原表位鉴定

Crystal Structure Analysis,Molecular Docking Simulation and Antigenic Epitope Identification of CD28 Nanobodies

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摘要CD28 作为以胞外可变免疫球蛋白样结构域为特征的共刺激分子亚家族的创始成员,是 T细胞中关键的共刺激受体,它与抗原提呈细胞表面的 B7(CD80、CD86)分子结合产生协同刺激信号,在癌症治疗中具有重要地位.但目前只有少量抗体药物开发管线.本研究利用原核表达纯化专利 CN114605540A 所筛选的抗 CD28 纳米抗体(anti-CD28 nano antibody,CD28 Nb),并通过酶联免疫吸附实验测定CD28 Nb 与 CD28 的结合活性.随后采用坐滴法获得晶体,利用 X 射线衍射技术剖析CD28 Nb 的晶体结构并用拉式图(ramachandran plots)评估模型质量,通过分子对接阐明其在 CD28胞外结构域上的结合表位.结果表明,CD28Nb 结构分辨率为 1.43 ?,空间群为 P41212,CD28Nb 在CD28 上的识别表位共 25 个.经对比发现,CD28Nb 与已发表的 CD28-抗体复合物的结合模式高度相似,凭借其广泛的结合界面展现出作为 CD28 信号调控工具的潜力.

作者艾泓如 ^[1] 郑欣亚 ^[1] 李光耀 ^[2] 王天天 ^[2] 周雪梅 ^[2] 李萌 ^[2] 陈成 ^[3] 于豪冰 ^[4] 胡适 ^[2] 学术成果认领

作者单位上海理工大学公利医院医疗技术学院再生医学与组织工程系,上海 200093 ^[1] 中国人民解放军海军军医大学基础医学院生物医学工程教研室,上海 200433 ^[2] 天津大学生命科学学院生物科学系,天津 300000 ^[3] 中国人民解放军海军特色医学中心,上海 200433 ^[4]

关键词单域抗体 CD28抗原分子对接模拟 X射线衍射结晶 single-domain antibodies CD28 antigens molecular docking simulation X-Ray diffrac-tion crystallization

分类号 Q71（生物大分子的结构和功能）

栏目名称

研究论文

DOI 10.13865/j.cnki.cjbmb.2025.11.1287

发布时间 2026-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）