摘要针对结肠癌标志基因选择问题,引入一种最高得分对(TSP)方法,处理一组包含40个肿瘤和22个正常样本的结肠癌微阵列数据,得到标志基因对(VIP,DARS)并构建双基因分类器.结果显示,该分类器对62例样本的分类准确率可达93.55%.进一步,利用荧光实时定量PCR在10个独立样本上检验所选基因对的分类效果,正确率为100%,表明该方法能有效地选择结肠癌标志基因,对临床诊断有积极的意义.
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关键词
标志基因结肠癌双基因分类器荧光实时定量PCR(Q-RT-PCR)marker genecolon cancertwo-gene classifierquantitative real-time PCR (Q-RT-PCR)
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0258-8021.2009.05.010
发布时间
2010-01-11
基金项目
国家自然科学基金重点项目(60774077);
北京市教育委员会发展计划
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