换一批基于连续-离散扩展卡尔曼建模的p53-Mdm2调控关系研究
Research of p53-Mdm2 Regulatory Networks Based on Modeling by Continuous-Discrete Extended Kalman Filter
摘要生物医学研究揭示,肿瘤抑制基因p53的表达水平与肿瘤的形成相关.p53相关的信号转导网络研究为揭示癌症、肿瘤的发病机制和寻找其治疗方法提供新思路,而p53和癌基因Mdm2的负反馈关系是该信号转导网络的核心部分.因此,研究p53-Mdm2的调控关系意义重大.基于电离辐射后人类白血病细胞中测得的时间序列基因表达数据,利用连续-离散的扩展卡尔曼(EKF)算法,建立带有延迟特性的非线性动态连续随机生物网络模型,模拟电离辐射后的p53-Mdm2动态调控过程.同时,对所建立网络的准确性进行验证,可得模型的误差率为0.85％.结果表明:所提出的算法是收敛的,可以预测基因的表达水平,准确地模拟p53-Mdm2调控网络受到电离辐射后的衰减震荡响应过程,该过程和生物实验结果一致.所提出的算法为生物学实验建模提供一种有效的方法,并可以为网络系统动力学特性的研究提供条件.
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关键词
p53-Mdm2网络连续-离散扩展卡尔曼(EKF)算法时间序列数据延迟p53-Mdm2 networkcontinuous-discrete extended Kalman filter (EKF) algorithmtime-series datadelay
分类号
R318（医用一般科学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0258-8021.2017.02.008
发布时间
2017-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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