换一批MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台
MedPortal: A Biomedical Ontology Repository and Platform Focused on Precision Medicine
摘要在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中.本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加.为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台.通过复用NCBO BioPortal技术,搭建MedPotal软件框架.遴选精准医学相关本体,建立本体资源库.对原框架中的代码和本体处理工具进行修正和完善,使之能够在本体稳定运行的基础上满足大批量数据的自动化处理.目前,该平台已整合42个生物医学本体,建立了本体之间术语映射关系,通过页面和REST API方式,提供术语检索、本体映射、数据标准化注释等本体应用服务(http://medportal.bmicc.cn).MedPortal本体平台将为生物医学数据整合提供帮助.
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关键词
生物医学本体MedPortal数据库本体映射本体注释biomedical ontologyMedPortaldatabaseontology mappingontology annotation
分类号
R318（医用一般科学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0258-8021.2017.05.007
发布时间
2017-11-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家国际科技合作专项基金（2014DFB30030）
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