摘要目的 研究HLA-B等位基因座位上的重组交换,探讨HLA新等位基因产生的分子遗传机制,预测分析重组氨基酸残基改变对编码蛋白分子三维空间结构的影响.方法 应用基于Luminex平台的聚合酶链式反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)方法对先证者进行HLA基因分型,采用直接DNA测序方法和基因克隆方法进行外显子 1～4 序列分析.将该基因序列经IMGT/HLA database中"Alignment"程序进行比对,以确定B等位基因重组发生的位置.用Swiss-Model软件进行同源建模后,采用Swiss Pdb Viewer软件对分子间三维结构进行模拟,FATCAT在线软件对分子间三维结构进行差异比对.结果 PCR-SSOP基因分型显示先证者HLA-B位点反应格局异常,疑为HLA新等位基因.基因克隆后测序结果显示,其中1 个等位基因为B*13∶02,另 1 个等位基因序列与所有已知HLA等位基因不同,与同源性最高的HLA-B*35∶01∶01∶01 基因序列相比在第 2 外显子c.259-c.299 位置发生 12 个碱基替换,导致了 8 氨基酸改变.该序列外显子 1、3、4及内含子 1、2、3 和外显子 2 在c.74-c.258 序列与HLA-B*35∶01∶01∶01 序列一致,外显子 2 的c.259-c.343 序列与HLA-B*46∶01∶01 序列完全一致.蛋白分子三维空间结构分析变异等位基因与B*35∶01∶01∶01 和B*46∶01∶01 结构相似,重组部位氨基酸p.63-p.79 局部氢键发生改变.结论 本研究在中国汉族人群发现了1 例B等位基因间重组形成的HLA新等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*35∶186,阐明了新等位基因产生的来源,为深入研究基因重组及HLA多态性形成机制提供了理论依据.