广西和云南树鼩群体遗传多样性的比较分析
Comparison of the genetic diversity between Guangxi and Yunnan tree shrew populations (Tupaia belangeri chinensis)
摘要目的:比较分析我国广西、云南两个树鼩群体的遗传差异和分化程度,推动树鼩优良品系的培育和优化实验动物模型。方法提取广西和云南各32只树鼩的全血基因组DNA,分别采用9对荧光标记微卫星引物进行PCR扩增,通过毛细管电泳技术检测扩增片段,并利用POPGENE等软件比较两个树鼩群体的遗传相关指标。结果广西和云南两个树鼩群体平均期望杂合度( He)为0?703,平均多态信息含量( PIC)为0?725,Fis均值>0。CCBL1B、CCDC61、EDA1和OPA3四个位点表现为极显著偏离哈迪?温伯格平衡。两群体的遗传距离及无偏遗传距离分别为1?277和1?268,遗传相似系数约为0?28。遗传结构变异的分布情况显示61?57%的微卫星遗传变异来自于群体内部,38?43%存在于群体之间。 STRUCTURE分析发现广西和云南树鼩为中缅树鼩群体的两个不同的亚种。结论广西和云南树鼩两个群体的遗传多样性都较丰富,两个群体间具有较大的遗传差异和分化程度,遗传变异主要来源于群体内部。
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