Prnp-SNCA-A53T帕金森病转基因小鼠肠道菌群差异

Differences in gut microbiota of Prnp-SNCA-A53T Parkinson' s disease transgenic mice

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摘要目的多项证据表明帕金森病患者肠道菌群失调,而Prnp-SNCA-A53T帕金森病转基因小鼠是否也存在肠道菌群失调尚未见报道,本研究拟对该模型小鼠的肠道微生物生态特征进行分析.方法采用illumina高通量测序技术对7只雌性转基因小鼠及13只同性别同周龄野生型小鼠粪便微生物16S rRNA基因V3-V4区进行测序及生物信息分析,并用PICRUST预测差异功能通路.结果与野生型组相比,A53T组小鼠肠道微生物α多样性有增高趋势,而且微生物组成及物种也具有显著性差异:A53T组小鼠肠道微生物在门水平,放线菌门增高(P=0.0094),拟杆菌门降低(P=0.0498);在纲水平,红蝽菌纲增高(P<0.0001),拟杆菌纲降低(P=0.0398);在目水平,红蝽杆菌目增高(P<0.0001),拟杆菌目(P=0.0398)及红细菌目降低(P=0.0185);在科水平,红蝽杆菌科增高(P<0.0001),拟杆菌科(P=0.0277)及红杆菌科降低(P=0.0185);在属水平,伊格尔兹氏菌属增高(P=0.0002),拟杆菌属(P=0.0277)及红杆菌属降低(P=0.0249).另外A53T组与野生型组在9个功能通路上存在显著差异,分别是G蛋白偶联受体、类固醇激素的合成、青霉素和头孢菌素的生物合成、泛醌和其他萜类醌的生物合成、甲苯降解的生物合成与代谢、聚糖的生物合成与代谢、电子转移载体、减数分裂以及非洲锥虫病.结论本研究结果表明转基因小鼠存在肠道菌群失调,同时转基因模型小鼠与野生型小鼠代谢通路存在差异,为后期研究肠道菌群菌与帕金森病的关联性提供了理论基础.