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融水小型猪线粒体 DNA 结构和系统进化的分析

Genomic and phylogenetic analysis of porcine mitochondrial genomes of Rongshui miniature pig

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摘要目的：研究融水小型猪的线粒体DNA结构和系统进化关系。方法选取了全基因组鸟枪法的测序策略对融水小型猪的外周血液样本进行测序，使用Illumina基因组分析测序技术构建paired-end文库进行末端测序，最后进行拼接及分析。结果融水小型猪的完整线粒体序列呈环形，总长为16888 bp，由13个编码蛋白基因、22个转运RNA和两个核糖体RNA构成。线粒体DNA的GC含量约为44％。系统进化分析、遗传多样性分析和中性检验证明了，在融水小型猪、兰屿猪、海南野猪和滇南7号这一类群中，发生了种群扩张。结论融水小型猪是中国传统猪种中比兰屿猪更为古老的小型猪。

作者徐嘉悦 ^[1] 施赫赫 ^[2] 王绪敏 ^[1] 高翔 ^[3] 余细勇 ^[4] 于军 ^[1] 唐小江 ^[5] 学术成果认领

作者单位中国科学院北京基因研究所,北京,100101 ^[1] 广东省医学实验动物中心，广东佛山 528248; 广东贝格生物科技有限公司，广东佛山 528100 ^[2] 南京大学模式动物研究所,南京,210061 ^[3] 广东省医学科学院,广州,510060 ^[4] 广东省医学实验动物中心,广东佛山,528248 ^[5]

关键词融水小型猪线粒体DNA 系统进化分析遗传多样性 Rongshui miniature pig ( RMP )Mitochondrial genome Phylogenetic analysis Genetic diversity

医学主题词猪, 雏型(Swine, Miniature)线粒体(Mitochondria)遗传(Heredity)性(Sex)猪(Swine)

分类号 R332（人体生理学）

栏目名称

研究报告

DOI 10.3969/j.issn.1671-7856.2015.03.007

发布时间 2015-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

国家重大研究计划（2011CB944101）国家自然科学基金（81120108003）国家自然科学基金（81330007）