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巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用

Establishment and application of CODEHOP PCR assay for detection of Pasteurella spp.in laboratory animals

摘要目的 建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考.方法 应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpoB)氨基酸序列设计简并引物.对建立CODEHOP PCR方法用21株参考菌株进行特异性和敏感性评价,并应用于实验动物中的巴斯德杆菌检测.结果 简并引物PastF6/PastR5扩增标准菌株的目的片段为200 bp左右.能够区分受试的巴斯德杆菌和主要的实验动物呼吸道病原菌.敏感性为0.2 pg/μL~2 pg/μL.在受试的609只实验动物中呼吸道样品中检测出巴斯德杆菌阳性率为19.1%.样品阳性片段经测序验证,准确率为100%.结论所建立的方法具有良好的特异性和敏感性,可用于动物样品中巴斯德杆菌的检测.

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作者 邢进 [1] 冯育芳 [1] 岳秉飞 [1] 贺争鸣 [1] 孙晓梅 [2] 代解杰 [2] 学术成果认领
作者单位 中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所,北京,100050 [1] 中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心,昆明,650118 [2]
分类号 R-332
栏目名称 技术方法
DOI 10.3969.j.issn.1671-7856.2017.01.017
发布时间 2017-04-10
基金项目
国家科技支撑计划项目
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