换一批基于ITS2序列的茄科酸浆属植物的DNA分子鉴定
DNA Molecular Identification of Physalis Medicinal Plants in Solanaceae by ITS2 Barcode Sequence
摘要目的:利用内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对茄科酸浆属植物进行分子鉴定.方法:对酸浆属与散血丹属植物样本的ITS2序列进行逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增和测序.为扩大研究范围,从GenBank 中下载了上述2个属植物样本的ITS2序列.所有序列经CodonCode Aligner V3.0.1软件拼接,DNAMAN软件比对分析,采用MEGA 5.10计算相关数据,基于K2P模型构建邻接聚类树.从ITS2数据库中获得所测样本及下载序列的ITS2二级结构信息,分析各样本间ITS2序列二级结构的差异.结果:从邻接聚类树分析可知,所有样本被聚为两大支.酸浆属植物自成1支,散血丹属植物为1支,且除极个别样本外,2个属的各物种种内样本可各为1支,表现出单系性;且每2支之间的Bootstrap支持率均很高.结论:ITS2序列在近缘物种间的系统学研究、品种的鉴定方面具有较大的应用潜力,适用于酸浆属植物的分子鉴定.
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关键词
内转录间隔区2DNA水平酸浆属二级结构散血丹属聚类分析internal transcribed spacer 2DNA levelPhysalissecondary structurePhysaliastrumcluster analysis
栏目名称
DOI
10.13422/j.cnki.syfjx.2016080022
发布时间
2016-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81173499）
辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划（LJQ2014101）
辽宁中医药大学杰出青年基金（20121228）
我国水生
耐盐中药资源的合理利用研究项目（201407002）
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