禽内源性反转录病毒ALVE1在鸡基因组上下游序列鉴定
IDENTIFICATION OF UPSTREAM AND DOWNSTREAM SEQUENCES OF AVIAN ENDOGENOUS RETROVIRUS ALVE1 IN THE CHICKEN GENOME
摘要已知鸡基因组中含有禽内源性反转录病毒ALVE1序列,而ALVE1在鸡基因组中的上游和下游区域位置在参考基因组中并未成功鉴定.本研究成功鉴定出ALVE1所在鸡基因组中的上、下游序列,并通过提取CEF细胞和DF-1细胞基因组反过来验证了ALVE1的位置信息.与参考基因组不同的是,我们发现ALVE1序列包含3'LTR序列,在鸡1号染色体上的插入位置为chr1:65,995,534~65,993,540.本研究不仅提供了ALVE1在鸡基因组中的完整信息,也为进一步研究ALVE1的功能奠定了基础.
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