换一批
换一批猪德尔塔冠状病毒RT-nPCR检测方法的建立与N基因变异分析
Development of RT-nPCR Detection Method for Porcine Deltacoronavirus and Analysis of N Gene Variation
摘要建立一种基于猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)N基因的RT-nPCR检测方法,对陕西省猪群PDCoV感染情况进行流行病学调查,分析PDCoV流行毒株N基因变异情况.通过病毒分离、检测引物设计、反应体系与条件优化、灵敏性试验和特异性试验,建立了PDCoV RT-nPCR检测方法,并对N基因片段进行序列分析.结果表明:建立的RT-nPCR方法能够扩增出303 bp的N基因目的片段,检测单链cDNA的极限为2.0194× 10-3 ng·μL-1,该方法检测PEDV、TGEV、PRoV、CSFV与PRRSV均无交叉反应,特异性良好;陕西省猪场184份样品检测结果显示,PDCoV阳性率为6.52％(12/184);N基因序列分析发现,获得的HY2019、QLS2020的N基因片段同源性为99.0％,提示可能为同一来源;进化树分析发现,HY2019、QLS2020与我国四川株SCNC201705、Sichuan2017、Sichuan2019同处于一个小的进化分支上,且均存在168～179位"TGTCTGTCTCTA"共12个核苷酸缺失,推测陕西株与四川株高度同源,可能起源于早期四川毒株.
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关键词
猪德尔塔冠状病毒仔猪腹泻检测反转录-聚合酶链式反应Porcine deltacoronaviruspiglet diarrheadetectionreverse transcription-polymerase chain reaction
分类号
S852.65
栏目名称
研究论文
发布时间
2024-03-26
基金项目
陕西省科技计划项目
咸阳职业技术学院重点科研项目
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