换一批赛鸽圆环病毒天津株全基因组的扩增和序列分析
Amplification and Characterization of a Circovirus from Racing Pigeons in Tianjin
摘要本研究利用PCR从有腹泻症状的鸽中检测到圆环病毒,进一步进行了全基因组扩增.基因组序列分析表明该基因组长度为2032 bp,编码5个开放阅读框(ORFs),5'端和3'端各存在一个基因间隔区.该基因组序列与已登录的中国、澳大利亚、日本、波兰、比利时和巴西的PiCV基因序列同源性为81.5％～97.7％.全基因组系统发育分析显示,54个序列(53个参考PiCV基因组序列和1个本研究PiCV基因组序列)可分为6个分支(A、B、C、D、E和F),本研究分离毒株位于B支,与来自比利时(DQ915957和DQ915958)、中国(KX108826、KX108805、KX108825、KJ704802 和 KJ704806)的分离株亲缘关系密切.Simplot 重组分析结果显示Rep ORFs包含多个重组热点,表明我国鸽圆环病毒存在遗传多样性.
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分类号
S852.65
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发布时间
2024-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
河北省科技厅重点研发计划（20326624D）
河北省高等学校科学技术研究项目（ZD2020314）
河北省高层次人才资助项目（A202003006）
河北省第二期现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队建设专项（HBCT2018150207）
河北北方学院校级科研项目（YB2020006）
河北北方学院校级科研项目（XT2021008）
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