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15株四川地区猪圆环病毒3型全基因序列的克隆与分析

Cloning and Genomic Analysis of 15 Strains of Porcine Circovirus Type 3 from Sichuan Province

摘要为了解四川省地区猪圆环病毒3型(PCV3)流行毒株的分子及遗传变异规律,试验采用生物学软件,设计3对特异性引物对从四川地区部分养殖场猪群中收集的15份PCV3阳性样品进行分段扩增、全基因序列遗传变异分析.结果表明:PCR分段扩增分别得到大小为623、803和753 bp的条带,阳性克隆菌测序结果与GenBank中PCV3的同源性均大于98.6%;15株样品毒株的全基因核苷酸序列的同源性为98.1%~99.8%,推导氨基酸序列的同源性为95.8%~99.2%,由Cap基因的遗传进化分析发现从四川地区获取的15株PCV3毒株属于3a和3b两个亚群.说明四川地区流行的PCV3毒株至少存在3a和3b 2个亚群,该亚群的变异程度低、较为保守.

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