换一批猪流行性腹泻病毒感染仔猪空肠组织的转录组学分析
Transcriptome Analysis of Jejunal Tissues of Piglets Infected with Porcine Epidemic Diarrhea Virus
摘要猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染仔猪可引起严重腹泻,导致肠道黏膜损伤、免疫功能低下.为探究PEDV感染仔猪空肠基因组转录水平的变化,筛选宿主免疫应答的差异表达基因,本研究收集PEDV感染仔猪的空肠组织,利用RNA-Seq技术进行转录组学测序分析.RNA-seq结果显示,与正常未感染仔猪相比,PEDV感染仔猪存在339个显著差异表达基因(DEGs),其中182个上调基因,157个下调基因.GO分子功能结果显示,免疫相关差异表达基因主要与免疫球蛋白和受体结合、T细胞增殖等有关.KEGG通路富集结果显示,差异表达基因主要涉及TNF信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Janus激酶/信号转导与转录激活子信号通路以及RIG-I受体信号通路等;最后再利用qRT-PCR对差异表达基因进行验证,其结果与转录组学结果基本一致.本研究为进一步研究PEDV感染导致宿主免疫应答变化机制提供了科学依据.
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关键词
猪流行性腹泻病毒转录组分析差异表达RNA-Seq先天免疫Porcine epidemic diarrhea virustranscriptome analysisdifferential expressionRNA-Seqinnate immune
分类号
S858.28
栏目名称
发布时间
2025-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广西自然科学基金资助项目（2021GXNSFAA196067）
大学生创新创业训练计划项目（202210593870）
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