动物源大肠杆菌MALDI-TOFMS质谱库的建立及在北京地区区域性差异应用分析
Characterization of Data Group for Escherichia coli from Animals with Regional Differences in Beijing Based on MALDI-TOF MS Technology
摘要为比较不同区域大肠杆菌是否具有差异性,本研究针对自北京市怀柔区收集分离的11株大肠杆菌和延庆区收集分离的22株大肠杆菌进行了鉴定,分别采用常规生化法、16S rRNA测序和基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的鉴定方法进行鉴定,比较了3种方法鉴定的准确率,并对获得的细菌肽质量指纹谱数据进行分析.结果显示:两地采集的大肠杆菌用3种方法鉴定,其准确性都在95%以上,其中MALDI-TOF MS鉴定采用多点点靶时准确率可达99%以上,多点点靶下MALDI-TOF MS鉴定重复性强、准确高、时间快;不同区域的大肠杆菌虽具有相似的肽质量指纹谱特征,但聚类分析和主成分分析显示所有数据可清晰地按地区聚成两簇,其中怀柔一簇、延庆一簇,两簇之间区分明显.表明自怀柔和延庆采集的大肠杆菌的肽质量指纹谱具有区域性差异,可为基于MALDI-TOF MS的大肠杆菌溯源性分析提供技术依据.
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