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猪繁殖与呼吸综合征病毒SH1/2022株的分离鉴定及基因组特征分析

Isolation and Genomic Characterization of SH1/2022 Strain of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus

摘要2022年末上海某猪场保育猪群出现持续发热等临床症状,为了确定该猪群的发病原因,本研究采集了发病猪临床样品进行了病原检测,结果显示,12份样品中有11份呈PRRSV阳性,并利用Marc-145细胞分离获得了 1株病毒,经过RT-PCR和IFA等鉴定,证实该毒株为PRRSV,将其命名为SH1/2022.对分离株SH1/2022进行全基因组测序和分析,结果显示,该毒株基因组全长为15 317 bp(不含poly A),与HP-PRRSV-like亲缘关系较近.重组分析结果表明,分离株SH1/2022是以谱系8的HP-PRRSV-like作为亲本毒株和谱系5的RespPRRS MLV疫苗毒株作为次要亲本毒株,发生谱系间重组而产生的毒株,基因组中含有两个重组断点nt9460和nt11398,分别位于Nsp9和Nsp11基因区域.我们推测造成该养猪场发病的原因可能是由谱系间毒株发生重组所致,提示该重组毒株仍然具有一定的致病性,有必要持续监测养猪场中PRRSV的流行动态.

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