换一批摘要本研究对猫DDX20的CDS区进行克隆、比对不同物种DDX20核苷酸序列和氨基酸序列,构建系统发育树,利用ExPASy ProtParam、DeepTMHMM等软件或在线工具对DDX20蛋白理化性质、二级结构等进行预测分析,并在mRNA水平上判断猫杯状病毒(FCV)对猫DDX20的影响.结果表明:成功克隆出猫DDX20基因CDS区,并上传GenBank,获得登录号:OR237969;生物信息学分析结果显示,猫DDX20蛋白为亲水性蛋白,无跨膜螺旋区和信号肽,有92个潜在的磷酸化修饰位点,3个潜在的N-糖基化位点和7个潜在的O-糖基化位点;亚细胞定位分析显示猫DDX20蛋白主要分布在细胞核(65.2％);进化分析表明,猫DDX20与老虎和豹子同源性较高;FCV感染会导致猫DDX20的mRNA水平升高,或对病毒的复制产生影响.本研究成功克隆猫DDX20基因CDS区,为后续猫DDX20蛋白功能研究奠定基础.
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