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鸡传染性支气管炎病毒CK/CH/GD/W0712株的分离鉴定及其基因序列分析

Isolation,Identification and Gene Sequence Analysis of Chicken Infectious Bronchitis Strain CK/CH/GD/W0712

摘要对广州某已接种疫苗鸡场采集疑似感染传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)的病鸡进行病毒分离及全基因测序,了解鸡传染性支气管炎病流行情况,为其防控提供理论依据.通过SPF鸡胚接种、鸡胚尿囊液的RT-PCR鉴定和全基因测序,对分离病毒进行遗传变异分析,进行S1基因和全基因组同源性分析,并构建遗传进化树;采用RDP4.95、Simplot3.5软件分析分离病毒株S1基因的重组事件.IBV分离株命名为CK/CH/GD/W0712,基因组全长为27 664 bp,不包含ployA尾,其中S1基因1620 bp,编码540个氨基酸,裂解位点为HRRKR,属于GI-19谱系(QX型).S1基因重组分析结果显示,分离株可能是由QXIBV株与I0118/14株重组而成.分离株CK/CH/GD/W0712属于基因型GI,除QX型疫苗株以外,与其他疫苗株S1基因同源性只有78.1%~86.0%,与疫苗株相比存在不同程度的变异,常用疫苗不能对其提供完全有效的保护.统计近5年中国在NCBI提交的IBV分离株,构建S1基因系统进化树,并绘制基因型与提交地域的IBV流行图,为广州地区IB的流行病学提供参考,也为IB的防控和疫苗研制选择提供指导.

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