换一批应用DNA微阵列对骨髓增生异常综合征患者骨髓单个核细胞基因表达谱的初步研究
Preliminary Study on the Gene Expression Profiles of Bone Marrow Mononuclear Cells from Patients with Myelodysplastic Syndrome by Using cDNA Microarray
摘要为了探讨应用DNA微阵列研究骨髓增生异常综合征(MDS)的基因表达谱的可行性,将2例患者骨髓单个核细胞RNA各取等量混合后进行逆转录Cy5标记,与Cy3标记的正常对照cDNA混合,与H141微阵列杂交、扫描、软件分析.结果H141s芯片中共点样13 484个基因克隆,其中1 064个靶克隆是由针对同一基因内不同序列的cDNA片段重复点样至少2次.重复点样检测结果表明:在2张芯片内各自完全一致的分别为625个(58.7%)和630个(59 2%),而存在完全相反结果的cDNA片段分别有21个(2.0%)和11个(1.0%).1 064个靶克隆中重复点样数据完整且分别在2张芯片内结果一致的共有411个,其中在2张芯片间结果也完全一致的共有400个(97.3%).2张芯片中MDS与正常对照比较存在差异表达的靶基因分别为1 549和1 311个,而2张芯片间表达差异一致的靶基因为409个,其中101个基因参与造血调控,主要涉及转录因子、细胞周期调节蛋白、代谢相关基因、表面黏附分子等.结论:DNA微阵列可用于对MDS患者混合标本的表达谱分析,为深入研究MDS的发病分子机理提供线索,但需要进行重复实验以降低微阵列操作过程引起的表达偏差.
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医学主题词
骨髓增生异常综合征(Myelodysplastic Syndromes)骨髓(Bone Marrow)细胞(Cells)基因表达谱(Gene Expression Profiling)研究(Research)
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-2137.2004.05.009
发布时间
2004-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
Scientific Bureau of Suzhou（(SZ0201)）
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