换一批
换一批HLA新等位基因B*13∶92的确认及蛋白质三级结构的初步分析
Identification of A Novel HLA-B * 13∶92 Allele and Analysis of Its 3D Model Structure
摘要目的:人类白细胞抗原(HLA)新等位基因B*13∶92的确认及蛋白质空间结构的分析.方法:应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT)进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结果与等位基因B*13∶01∶01,B*58∶01∶01在189位有1个碱基不匹配,不能指定为任何HLA-B位点等位基因,用针对B*13、B*58的组特异性测序引物(GSSP),确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异,使用SWISS-MODEL方法建立该新基因的空间模型并进行分析.结果:测序结果证实,该等位基因与其同源性最高的等位基因是B* 13∶01∶01,两者的差异是在第2外显子189位的C＞A,密码子39由GAC变为GAA,编码的氨基酸由天冬氨酸(D)转变为谷氨酸(E).空间结构分析表明替代氨基酸位于抗原肽结合区α螺旋上.结论:该等位基因是在中国广西壮族人群发现的一个新HLA-B位点等位基因,世界卫生组织(WHO) HLA命名委员会将其正式命名为HLA-B* 13∶ 92.
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关键词
人类白细胞抗原新等位基因B* 13∶92蛋白质三级结构Human leukocyte antigenHLA-B * 13∶92 alleleprotein 3D model structure
分类号
R457.1
栏目名称
输血医学
DOI
10.7534/j.issn.1009-2137.2016.05.049
发布时间
2016-11-30
基金项目
南宁市科学研究与技术开发计划项目
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