换一批TP53突变型骨髓增生异常综合征对地西他滨耐药的表观遗传调控:基于RNA-seq与甲基化组学的整合分析
The Epigenetic Regulation of Decitabine Resistance in TP53-Mutated Myelodysplastic Syndromes:Integrated Analysis Based on RNA-seq and Methylomics
摘要目的:探讨在骨髓增生异常综合征(MDS)中TP53基因不同突变状态(野生型/突变型)对地西他滨(DAC)耐药性的影响,并筛选耐药相关调控基因.方法:选用2种TP53状态差异的MDS细胞:M-07e:野生型;SKM-1:突变型,用递增浓度(0、0.5、1、5和10 μmol/L)的地西他滨干预0-72 h后,采用CCK-8法检测细胞活力.通过RNA-Seq转录组测序和甲基化组学分析,筛选与耐药相关的关键基因.结果:CCK-8实验结果显示DAC对M-07e和SKM-1细胞活力的抑制作用呈时间和剂量依赖性(SKM-1耐药性最强,IC50=5 μmol/L vs M-07e IC50=0.5 μmol/L,P＜0.01).基因表达分析结果显示,M-07e细胞经DAC处理后共鉴定到662个上调基因和452个下调基因;SKM-1细胞经DAC处理后共发现515个上调基因和73个下调基因.蛋白质组学检测显示:DAC处理的M-07e细胞中共鉴定117个上调蛋白和136个下调蛋白;DAC处理的SKM-1细胞中发现91个上调蛋白和46个下调蛋白.通过整合分析上调基因和蛋白表达谱,共筛选出181个候选基因.甲基化组学分析发现884个低甲基化基因中存在高敏感位点和高CpG密度区域,其中与上述181个候选基因存在交集的共31个基因,GO功能富集分析表明这31个基因主要参与细胞分化正调控、结合过程负调控以及细胞组分组织负调控等生物学过程.结论:TP53突变通过表观遗传重编程介导DAC耐药,靶向这些基因可能改善TP53突变型MDS的预后.
更多相关知识
关键词
TP53基因骨髓增生异常综合征地西他滨耐药机制表观遗传调控TP53myelodysplastic syndromesdecitabinedrug resistanceepigenetic regulation
分类号
R551.3（血液及淋巴系疾病）
栏目名称
DOI
10.19746/j.cnki.issn1009-2137.2025.06.019
发布时间
2025-12-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
山西省重点实验室开放课题项目（KFKT2024003）
山西省科技合作交流专项（202304041101043）
- 浏览6
- 被引0
- 下载1
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
