基于网络药理学、聚类分析和分子对接探讨胃力康颗粒干预慢性浅表性胃炎的作用机制
Exploring the mechanism of Weilikang granules in intervening chronic superficial gastritis based on network pharmacology,cluster analysis and molecular docking
摘要目的 运用网络药理学、聚类分析和分子对接技术,分析胃力康颗粒干预慢性浅表性胃炎(CSG)的作用机制.方法 通过 BATMAN-TCM 数据库收集胃力康颗粒成分和靶标,GeneCards 数据库收集 CSG 靶标,绘制韦恩图得到交集靶标,并进行 GO 功能富集分析和 KEGG 通路富集分析.通过STRING数据库建立蛋白质相互作用网络(PPI网络),Cytoscape 3.10.2软件构建"药味-成分-靶标-疾病"相互作用网络,采用多个拓扑指标筛选出胃力康颗粒干预 CSG 的活性成分和核心靶标.通过聚类分析筛选与 CSG 常见治疗化学药相关的有效成分.进一步从活性成分、核心靶标和有效成分中筛选关键成分和关键靶标,并使用 AutoDock Vina 1.2.5 和 PyMOL 3.0.3 软件进行分子对接及可视化处理.结果 共收集胃力康颗粒成分 424 个,成分对应靶标 2062 个,CSG 疾病靶标 1138 个,交集靶标 463 个.富集分析发现胃力康颗粒可能通过抗炎、调控免疫与肠道菌群干预 CSG.通过多个筛选方法得到 16 个关键成分:柴胡皂苷 D、丹酚酸 A、芍药苷等;10 个关键靶标:表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素 8(CXCL8)、肿瘤坏死因子(TNF)等.分子对接结果显示关键成分和关键靶标之间结合稳定.结论 胃力康颗粒药味的关键成分与关键靶标蛋白相互作用,调控潜在信号通路,进而通过抗炎、免疫调控、菌群调节等作用干预CSG.
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