换一批基于单细胞测序数据探索阿尔茨海默病的发病机制
Exploring the pathogenesis of Alzheimer's disease based on single-cell sequencing data
摘要目的 应用单细胞测序技术探索阿尔茨海默病的发病机制.方法 从单细胞转录组数据库下载疾病组及对照组数据,下载后进行数据质控,利用Seurat软件进行数据整合、聚类,利用T-分布随机邻域嵌入和一致流形逼近与投影软件进行图的可视化.利用SingleR与人工检查的综合方式完成细胞注释,最后将进一步进行基因差异分析、拟时序分析、细胞间通讯分析.结果 细胞图谱构建结果显示:疾病组细胞类型为中性粒细胞、小胶质细胞、神经元以及星形胶质细胞.对照组细胞类型为神经元与星形胶质细胞;基因表达差异结果显示:CD74、B2M、SPP1、NEAT等基因在两组数据中均差值较为显著;拟时序分析结果显示:疾病组中神经元分布不均,对照组中的神经元均匀分布,星形胶质细胞则是相反的结果.细胞间通讯分析显示:在疾病组中神经元与其他细胞类型的细胞间通讯较弱,而星形胶质细胞细胞与其他细胞通讯作用强,小胶质细胞与其他细胞也有着若干受体配体对以及信号转导通路.并且小胶质细胞与星形胶质细胞通过SPP1信号通路进行细胞间相互作用的数量多.结论 本研究通过单细胞测序技术得知在疾病组CD74、B2M、SPP1、NEAT1等基因表达量较高,且SPP1通路间的细胞相互作用可能为阿尔茨海默病的潜在发病机制.
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关键词
单细胞转录组测序阿尔茨海默病数据图谱拟时序分析细胞通讯Single-cell transcriptome sequencingAlzheimer's diseaseData graphPseudo time series analysisCel-lular communication
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-4287.2025.06.003
发布时间
2025-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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