换一批基于LIMMA与PPI筛选糖尿病肾病中的潜在关键基因
Identifying potential key genes in diabetic nephropathy through LIMMA and PPI analysis
摘要目的 本研究采用LIMMA算法筛选糖尿病肾病中差异表达基因(DEGs),并通过蛋白质互作网络(PPJ)进一步确定其中的关键基因,以揭示糖尿病肾病潜在的关键靶点.方法 基于GEO数据库及R软件包"LIMMA"对糖尿病肾病进行差异表达基因的筛选,并对DEGs进行KEGG及GO富集分析.蛋白质互作网络(PPI)的构建通过STRING数据库完成,并经Cytoscape中CytoNCA算法确定Hub基因,同时对筛选出的Hub基因进行诊断性能评估.结果 通过3个GEO数据集筛选出24个DEGs(logFC＞1,P＜0.05).GO及KEGG分析显示,DEGs在转化生长因子-β生成、免疫系统过程的调控、ECM受体相互作用等生物学功能中显著富集.同时,构建的蛋白互作网络最终确定6个Hub基因.ROC曲线分析中,Hub基因FN1、COL1A2的诊断性能最优.结论 通过LIMMA与 Cy-toNCA算法,筛选出6个Hub基因,并经ROC曲线进行诊断性能分析,确定FN1、COL1A2可以作为糖尿病肾病诊断和治疗的潜在关键靶点.
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关键词
糖尿病肾病功能富集分析蛋白互作网络诊断性能生物标志物Diabetic nephropathyFunctional enrichment analysisProtein-Protein interaction networkDiagnostic performanceBiomarkers
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-4287.2025.06.010
发布时间
2025-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
黑龙江省中医药管理局中医药科研课题项目（ZHY2023-098）
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