换一批浙江省猪圆环病毒2型流行株遗传变异分析
Genetic Variation Analysis of Porcine Circovirus Type 2 Epidemic Strains in Zhejiang Province
摘要为了解浙江省猪圆环病毒2型(PCV2)基因型和遗传变异情况,本试验对2021年采自浙江省不同地区的27份PCV2阳性病料进行PCV2全基因组扩增、克隆和测序,并将其全基因组、ORF2基因核苷酸序列及其推导的Cap蛋白氨基酸序列与不同国家和地区的流行株进行遗传变异分析.结果显示,27株PCV2流行株之间全基因组和ORF2基因核苷酸序列同源性分别为91.0％～99.9％和81.7％～99.9％,与不同国家和地区的PCV2参考株之间全基因组和ORF2基因核苷酸序列同源性为90.7％～99.9％和81.8％～100％.遗传进化树分析显示,27株PCV2流行株分别处于4个分支,其中8株为PCV2a基因型,6株为PCV2b基因型,12株为PCV2d基因型,1株为PCV2e基因型.27株PCV2流行株Cap蛋白的糖基化位点和核定位信号区氨基酸序列呈高度保守,B细胞抗原表位和T细胞抗原表位存在多个氨基酸突变.结果表明,浙江省多种基因型PCV2共存,以PCV2d基因型流行为主.本试验结果对于了解浙江省PCV2流行毒株的基因型和变异状况具有重要的意义.
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