北京地区食源性沙门菌消毒剂抗性基因和耐药基因分布及相关性分析
Distribution and Correlation Analysis Between Disinfectant Resistance Genes and Antibiotic Resistance Genes of Foodborne Salmonella spp.in Beijing
摘要为了解北京地区消毒剂抗性基因分布、携带情况及其与耐药基因之间的关系,本试验采集北京市6 个行政区共计39 家超市及农贸市场的猪肉和鸡肉样品,分离培养沙门菌并进行鉴定,随后结合Seqsero2、Staramr和Diamond等生物信息学软件对沙门菌的消毒剂抗性基因和耐药基因进行筛选与分析.结果显示,从 28 家超市和 11 家农贸市场的 148 份猪源和147 份鸡源样品中共分离得到79 株(26.78%)沙门菌.所有分离菌株共预测得到17 种血清型,其中71 株鉴定得到16 种序列型(ST),大部分分离菌株的血清型与ST型一一对应,其中优势菌株为肠炎沙门菌ST11(n =24).共检出 32 个消毒剂抗性基因,其中非共同携带的抗性基因有 5 个,包括外膜孔道蛋白基因opmD/npmC(携带率 72.15%)、有机汞调控蛋白基因merR2(携带率37.97%)、季铵盐类消毒剂抗性基因qacEΔ1(携带率 21.52%)和qacF(携带率 12.66%)、外排泵基因oqxAB(携带率1.27%).共检测出50 个耐药基因,覆盖氨基糖苷类、大环内酯类和四环素类等共10 类抗菌药物,其中氨基糖苷类占比最高(36.00%).相关性分析结果显示,消毒剂抗性基因个数与耐药基因种类数量之间存在显著的正相关(R =0.43,P =6.3×10-5),提示沙门菌在携带消毒剂抗性基因的同时,可能也携带更多种类的耐药基因.本试验为指导食品消毒剂的合理使用、保障北京地区食品安全和疾病预防提供理论支持,具有公共卫生学意义.
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