换一批猪焦孔素B同源异构体的鉴定、生物信息学和功能分析
Identification,Bioinformatics,and Functional Analysis of Porcine Gasdermin B Isoforms
摘要焦孔素(GSDM)家族成员焦孔素B(GSDMB)在感染性疾病、癌症和炎症性疾病中发挥关键调控作用.为了阐明猪GSDMB(pGSDMB)的组织分布、同源异构体特征及其功能活性,本试验采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测pGSDMB在不同细胞系和组织中的转录水平;通过PCR克隆并鉴定其同源异构体;结合生物信息学方法预测并分析其蛋白结构;采用乳酸脱氢酶(LDH)释放试验和碘化丙啶(PI)染色评估其N端结构域的焦亡活性.qPCR结果显示,pGSDMB在猪回肠上皮细胞(IPI-2I)和猪肠道组织中高表达.本试验首次鉴定出pGSDMB存在pGSDMB2和pGSDMB3两种同源异构体.结构分析显示,与pGSDMB3相比,pGSDMB2缺失由21个氨基酸组成的结构区域(β-折叠结构和部分无规则卷曲区域).功能试验证实,与空载体对照相比,pGSDMB N端1～245位氨基酸具有极显著焦亡活性(P<0.000 1),而缺失21个氨基酸的pGSDMB N端1～222位氨基酸则丧失该功能.综上所述,本试验检测了pGSDMB在不同细胞系和组织中的转录水平,揭示了其同源异构体的序列差异和结构特征,并确定了pGSDMB N端的焦亡活性区域(1～245位氨基酸区域),为深入理解pGSDMB的生物学功能及其在各种疾病中的作用提供了科学依据.
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关键词
猪焦孔素B(GSDMB)组织分布同源异构体结构分析功能活性porcinegasdermin B(GSDMB)tissue distributionisoformsstructural analysisfunctional activity
分类号
S858.28
栏目名称
DOI
10.20157/j.cnki.zgsyzz.2025.09.007
发布时间
2025-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
兽医公共卫生安全全国重点实验室开放基金课题（20.24SKLⅤPHS02）
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