新疆边境地区蜱种类及图兰扇头蜱遗传多样性分析
Analysis of Tick Species and Genetic Diversity of Rhipicephalus turanicus in Border Areas of Xinjiang
摘要为了解新疆维吾尔自治区察布查尔锡伯自治县和霍城县蜱种类及图兰扇头蜱遗传多样性.本试验采用形态学鉴定方法对蜱种进行初步鉴定,并基于蜱线粒体16S rRNA基因序列进行扩增并测序,运用MEGA11.0软件构建系统进化树,对蜱携带发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)、蜱传脑炎病毒(TBEV)、阿龙山病毒(ALSV)、克里米亚-刚果出血热病毒(CCHFV)的情况进行实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测,对优势蜱种进行遗传多样性分析.结果显示,采集的670只蜱隶属3属3种,其中图兰扇头蜱为优势蜱种,占比67.16%(450/670),亚洲璃眼蜱占比31.79%(213/670),边缘革蜱占比1.04%(7/670),两县间蜱种分布差异极显著(χ2=19.733,P<0.01).病毒检测结果显示,所有样品均为阴性.24条图兰扇头蜱16S rRNA基因序列的总体核苷酸多样性(Pi)为0.010 65,单倍型多样性(Hd)为0.873,共得到13个单倍型;中性检验与核苷酸错配图结果显示,4个群体近期都未经历群体扩张;分子变异方差分析(AMOVA)结果进一步提示,遗传变异主要源于群体内变异(94.52%),群体间变异仅占比5.48%.结果表明,在察布查尔锡伯自治县和霍城县采集的优势蜱种为图兰扇头蜱,遗传多样性丰富,能够适应不同的自然环境,为了解图兰扇头蜱生物多样性及蜱传疾病提供数据支持.
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