基因组学平台CM-GP的开发及其在病原微生物检测领域的应用
Development of genomics platform CM-GP and its application in the detection of pathogenic microorganisms
摘要利用宏基因组测序技术快速准确地进行病原微生物检测,对于感染性疾病的治疗和突发疫情的处置至关重要.然而,测序数据的分析涉及众多专业工具和数据库,这对IT基础相对薄弱的检测人员来说极具挑战.因此,本研究开发了基因组学平台(CM-GP),集成生物信息学分析常用工具和数据库,支持二代高通量测序、生物蛋白纳米孔测序以及最新一代固态纳米孔测序技术.同时,CM-GP针对不同测序技术内置了数据分析工作流,可从原始数据一键生成包含病原微生物丰度信息的检测报告.CM-GP的有效性已在慢性阻塞性肺病研究中得到初步验证.利用CM-GP,检测人员在6小时内即可完成1例测序数据的分析,提升了检测效率和准确度.
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