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首页 > 中国天然药物 > 水母溶血毒素的生物信息学分析

水母溶血毒素的生物信息学分析

Bioinformatic Analysis on Jellyfish Hematoxin

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摘要目的与方法:为阐明已报道的5种水母溶血毒素的氨基酸组成和序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构,保守区域、分子进化关系等,利用生物信息学方法对其进行了分析和预测.结果与结论:不同水母溶血毒素的氨基酸组成和理化性质相类似;水母溶血毒素存在跨膜结构域和疏水区域;在20～21位点最有可能存在信号肽切割位点:α螺旋、不规则卷曲是二级结构中最大量的结构元件,β折叠散布于整个蛋白质中;在其中3种水母毒素蛋白中存在4个保守区;以MP法和NJ法构建的系统发生树基本一致.

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作者 欧阳春磊 [1] 高佳栋 [1] 任玉坤 [1] 肖良 [2] 王倩倩 [2] 郭玉峰 [2] 蔡滨欣 [2] 张黎明 [2] 学术成果认领
作者单位 第二军医大学研究生管理大队学员11队,上海,200433 [1] 第二军医大学海医系防化医学教研室,上海,200433 [2]
关键词 水母溶血毒素生物信息学JellyfishHematoxinBioinformatics
医学主题词 溶血(Hemolysis)计算生物学(Computational Biology)方法(Methods)膜(Membranes)蛋白(Egg White)
分类号 Q811.4（生物工程学仿生学）
栏目名称
论文
发布时间 2009-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
上海市自然科学基金（06ZR14111;06Z020）
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中国天然药物

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2009年7卷2期

145-149页

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