换一批引起深圳市一起疱疹性咽峡炎暴发的柯萨奇A4病毒的鉴定及其VP1区序列分析
Identification and sequence analysis of the VP1 gene of coxsackievirus A4 that cause an outbreak of herpangina in Shenzhen area
摘要目的 鉴定引起2012年深圳市罗湖区一起疱疹性咽峡炎暴发的病原体,并对鉴定的柯萨奇A4病毒(coxsackie virus A4,CVA4)的VP1基因进行全长的序列测定和遗传进化特征分析.方法 采集罗湖区某幼儿园疱疹性咽峡炎暴发期间患儿的4份咽拭子样本和1份粪便标本,采用荧光RT-PCR法鉴定CVA4病毒,对阳性样本采用RT-PCR方法扩增CVA4病毒VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和系统进化分析.结果 病原学检测结果显示,引起此次疱疹性咽峡炎暴发的病原体为CVA4病毒.同源性分析显示,引起深圳疱疹性咽峡炎的CVA4病毒SZ-SK12030005、SZ-SK12030007与山东省2010株(KF150144)进化关系最近,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.4％和99.5％;与2006年吉林株(JQ715708)的同源性最低,核苷酸和氨基酸同源性分别为87.9％和96.6％.VP1区亲缘进化树显示CVA4-SZ-SK12030005和CVA4-SZ-SK12030007属于GⅠB亚型.结论 GⅠB型CVA4病毒是引起此次深圳市疱疹性咽峡炎疫情的病原体.
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