换一批上海地区分离的大肠埃希菌O157的分子分型研究
Study on the molecular typing of Eschierichia coli O157 isolated in Shanghai
摘要目的 对2006年-2014年在上海地区分离的大肠埃希菌O157进行分子分型研究.方法 通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)技术的联合应用,对来自中国上海地区的16株大肠埃希菌O157分离株和4株标准株进行分子分型研究.结果 PFGE方法可将20株菌株分为12种型别,分辨力为0.921 1.其中14株O157:H7菌株处于同一聚类,其与6株O157:H?菌株为不相关菌株.MLST方法可将20株菌株分为6种ST型,分辨力为0.726 3.7个管家基因的核苷酸多态性范围为0.000 784 ～0.009 449.其中14株O157:H7菌株分为ST2966型和ST11型,属于同一克隆群.6株O157:H?分离株分为4种ST型,包括3种新的ST型,且与本研究中的O157:H7菌株间的管家基因型别相差至少6个.结论 上海地区从动物和患者粪便中分离的大肠埃希菌O157:H7分离株间的遗传谱系接近,与本实验研究中的大肠埃希菌O157:H?菌株间亲缘关系较远.需加强对上海地区大肠埃希菌O157的病原学监测,并进一步比较2种分型技术对大肠埃希菌O157的分型效果.
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关键词
大肠埃希菌O157脉冲场凝胶电泳多位点序列分析Escherichia coli O157Pulsed-field gel electrophoresisMulti locus sequence analysis
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发布时间
2016-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
上海市高等学校青年教师培养资助计划（ZZYYZK13002）
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