换一批
换一批摘要目的 通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析久坐影响成年人胰岛素敏感性的关键基因及其相关功能和机制.方法 针对下载于NCBI的人类基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库的数据集GSE9103,利用WGCNA进行模块化分析,并通过相关性分析和网络可视化确定模块内关键hub基因及其调控网络,再对关键hub基因进行基因本体GO分析和基因集富集GSEA分析.结果 通过构建共表达网络,最终得到5个基因模块,其中yellow模块与久坐呈正相关,而NDUFA9为其枢纽基因;tan模块与久坐呈负相关,而MYBPC2为其枢纽基因.进一步对GO和GSEA分析发现,yellow模块基因包括NDUFA9主要发挥线粒体形成、有氧呼吸、脂肪酸降解等生物学功能并参与物质代谢、三羧酸循环、阿尔茨海默氏症、帕金森病相关通路;而tan模块基因包括MYBPC2则与骨骼肌收缩、糖原代谢、心脏发育相关.结论 本研究通过构建基因共表达网络筛选出与久坐生活方式显著相关的2个关键基因模块和2个枢纽基因;这2个模块基因分别通过线粒体功能、物质代谢和骨骼肌收缩、糖原代谢而影响成年人对胰岛素的敏感性.
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分类号
R192.3
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-3674.2020.06.020
发布时间
2021-02-05
基金项目
国家自然科学基金项目（81302023）；
江苏省教育科学"十三五"规划立项课题（D/2020/03/74）；
江苏省教育科学"十二五"规划立项课题（Ba/2015/01/057）；
江苏高校"青蓝工程",江苏省高职院校教师专业带头人高端研修项目
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