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首页 > 中国微生态学杂志 > 基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析

基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析

Quantitative analysis of the relationship of bacteria based on the dinucleotide frequency profile

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摘要目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系.方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征.采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离.结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是相近的物种,Pearson相关系数越大,PCC距离越小.结论该方法对细菌亲缘关系的定量描述做了有益的探索.

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作者 张宇镭 [1] 赵立平 [1] 学术成果认领
作者单位 上海交通大学生命科学技术学院,微生物分子生态与生态基因组学实验室,上海,200240 [1]
关键词 Pearson相关性系数双核酸频率特征向量基因组特征
医学主题词 细菌(Bacteria)基因组(Genome)性(Sex)方法(Methods)目的(Goals)
分类号 R3（基础医学）
栏目名称
论著
DOI 10.3969/j.issn.1005-376X.2006.04.001
发布时间 2006-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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中国微生态学杂志

中国微生态学杂志

2006年18卷4期

261-263页

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