换一批
换一批基于高通量测序的三峡库区重庆段黄胸鼠肠道菌群分析
Gut bacteria of Rattus tanezumi in Chongqing section of Three Gorges Reservoir area,China based on high throughput sequencing
摘要目的 研究三峡库区重庆段黄胸鼠肠道细菌的群落结构和多样性,初步了解库区黄胸鼠携带病原体的本底资料.方法 对三峡库区重庆段32例黄胸鼠的粪便样品进行16S rDNA高通量测序,分析黄胸鼠肠道菌群多样性、丰度和群落结构.结果 三峡库区重庆段黄胸鼠肠道菌群主要以厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门为主.在属水平上,优势菌属包括乳杆菌属、Cellulosilyticum、八叠球菌属等.不同县(区)黄胸鼠肠道菌群结构不同,丰都县(FD)和涪陵区(FL)的菌群结构相似度较高,巫山县(WS)、开州区(KZ)、忠县(ZX)、奉节县(FJ)和云阳县(YY)5个区县群落结构相似度较高;三峡库区重庆段黄胸鼠肠道菌群结构相似度秋季明显高于春季.32份鼠粪样本测序结果提示含有葡萄球菌属、双歧杆菌属、沙门氏菌属、螺杆菌属等致病菌和条件致病菌.结论 初步了解了三峡库区重庆段黄胸鼠的肠道菌群特征以及库区内地域性、季节性差异,黄胸鼠肠道中携带大量的致病菌和条件致病菌,应引起高度重视.
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关键词
三峡库区黄胸鼠高通量测序肠道菌群物种多样性Three Gorges Reservoir RegionRattus tanezumiHigh throughput sequencingGut microbiotaSpecies di-versity
栏目名称
DOI
10.13381/j.cnki.cjm.202405002
发布时间
2024-07-08
基金项目
重庆市自然科学基金面上项目（CSTB2022NSCQ-MSX0572）；
重庆市英才计划（cstc2022ycjh-bgzxm0251）
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