换一批基于网络药理学、分子对接和化学信息学方法探索益肺健脾方治疗肺纤维化的物质基础
Explore the Material Basis of Treating Pulmonary Fibrosis with Yifei Jianpi Prescription Based on Network Pharmacology, Molecular Docking and Chemical Informatics
摘要目的 运用网络药理学、分子对接以及化学信息学方法探索益肺健脾方治疗肺纤维化的分子机制和物质基础.方法 TCMSP、TCMID数据库下载益肺健脾方11味中药化合物.利用SwissTargetPrediction预测化合物潜在靶点,运用Cytoscape构建化合物-靶点网络.TTD、Drugbank筛选肺纤维化相关靶点,STRING分析靶点蛋白互相作用并进行GO分析和KEGG分析.进一步采用分子对接对化合物与肺纤维化关键靶点整合素αvβ6的亲和能力进行评估,对筛选得到活性较高的化合物进行化学信息学层次聚类分析.结果 益肺健脾方与肺纤维化共有靶点27个,PPI分析得到关键靶点6个,GO分析和KEGG分析得到GO条目336个、KEGG通路35条.分子对接获得了具有靶向αvβ6潜在亲和力的成分,eRo5规则和打分排名筛选30个化合进行化学信息学聚类分析,结果显示化合物Naphthol aS-bl phosphate、Tangshenoside ⅣV_ qt、 (2R)-2-azaniumyl-3-(1H-indol-3-yl)propanoate、 (3S)-3-azaniumyl-4-hydroxy-4-oxobutanoate、[(2R)-2-Formyloxy-3-phosphonooxypropyl] formate所代表的骨架结构具有潜在抑制肺纤维化活性,主要相互作用为氢键和疏水相互作用.结论 本研究为中医药抗新冠病毒引起肺纤维化的治疗和相关医方的研究提供基于生物信息学、网络药理学、分子对接、化学信息学的系统研究方法.
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分类号
R285.6（中药学）
栏目名称
DOI
10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2020.08.001
发布时间
2020-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
甘肃省新型冠状病毒肺炎(NCP)（NCP）
国家科技重大专项（2020）
甘肃中医药大学新型冠状病毒感染的肺炎应急防治专项项目（2020XGZX-01）
甘肃中医药大学新型冠状病毒感染的肺炎应急防治专项项目（2020XGZX-02）
甘肃省高等学校科研项目（2017A-048）
甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金（FZYX20-1）
甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金（FZYX20-2）
甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金（FZYX20-3）
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