基于网络药理学探讨新止骨增生丸治疗膝骨关节炎的作用机制
Mechanism of action of New Zhigu Zengsheng Pill in the treatment of osteoarthritis of the knee by using network pharmacology
摘要目的 运用网络药理学方法探索新止骨增生丸治疗膝骨关节炎(KOA)的潜在作用机制.方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选新止骨增生丸的活性成分及其作用靶点;利用 GeneCards、OMIM 和 DisGeNet 数据库检索 KOA 疾病的相关靶点;通过 Venny 2.1.0 在线平台对新止骨增生丸的活性成分作用靶点与 KOA 疾病相关靶点映射取交集,得到新止骨增生丸治疗 KOA 的关键靶点(共同靶点);将共同靶点导入String 平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,并将结果导入 Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑分析,提取核心靶点;运用注释、可视化和集成发现(DAVID)数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用 Cytoscape 3.7.1软件构建"活性成分-关键靶点-通路"网络.结果 共获得活性成分 54 个,对应靶点 262 个,疾病靶点 2459 个,共同靶点 142 个,经过蛋白互作及拓扑分析,得到核心靶点 13 个,GO 功能富集分析得到821 个生物过程(BP),94 个细胞组分(CC),139 个分子功能(MF)和 167 条通路(P<0.05).将"活性成分-核心靶点-通路"网络图进行拓扑分析,共筛选出槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素、山柰酚等 12 个核心成分,以及肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)等16个关键靶点.结论 新止骨增生丸可能通过槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚等主要活性成分,作用于 AKT1、TNF、VEGFA 等核心靶点,通过高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、TNF 等信号通路,协同发挥对 KOA 的治疗作用.
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